cDNA

cDNA (od ang. complementary DNA), komplementarny DNA – DNA uzyskany poprzez odwrotną transkrypcję na matrycy mRNA[1][2].

Biblioteki cDNA

Zbiór klonów komórek bakteryjnych zawierający cDNA komplementarny do mRNA całego transkryptomu danego organizmu nazywamy biblioteką cDNA[3]. Ze względu na to, że mRNA jest efektem transkrypcji genów, cDNA reprezentuje zestaw sekwencji produktów genów ulegających ekspresji w danej komórce[4], jest to istotne gdyż profile ekspresji białek różnią się między komórkami pochodzącymi z różnych tkanek[5].

Zastosowanie

Cechą charakterystyczną genów eukariotycznych są introny, które muszą być usunięte w procesie składania hn-mRNA[6]. W związku z tym na podstawie cDNA i znajomości sekwencji genu, którą możemy uzyskać z baz danych lub z bibliotek genomowych możemy wykrywać introny w genach eukariotycznych oraz badać splicing alternatywny, który może być swoisty, na przykład na poziomie organelli komórkowych, tkanek lub narządów (tzw. profile ekspresji[5]).

Przypisy

  1. ↑ F. M. Ausubel, R. Brent, R. E. Kingston, D. D. Moore, J.G. Seidman, J. A. Smith, K. Struhl, Current protocols in molecular biology, Chapter 5, Section I, Unit 5.2, Willey & Sons, 2003, ​ISBN 047150338-X​ (ang.)
  2. ↑ F. M. Ausubel, R. Brent, R. E. Kingston, D. D. Moore, J.G. Seidman, J. A. Smith, K. Struhl, Current protocols in molecular biology, Chapter 5, Section III, Unit 5.4, Willey & Sons, 2003, ​ISBN 047150338-X​ (ang.)
  3. ↑ "John Wagner at Cornell University Medical College, Isolation and use of cDNA clones".
  4. ↑ " A cDNA library contains only those DNA sequences that are transcribed into mRNA, Pierce, Benjamin. Genetics: A Conceptual Approach, 2nd ed. (New York: W. H. Freeman and Company).
  5. ↑ a b Kanyon Colleg, Course BIOL114, Chapter 11. Development: Differentiation and Determination.
  6. ↑ L. Stryer, J. M. Berg, J. L. Tymoczko, Biochemia, rozdział 4, sekcja 4.6, wyd. IV, PWN 2011, ​ISBN 978-83-01-15811-8​

Linki zewnętrzne

  • [1] (ang.) [dostęp 20.10.2020]