Interkalacja (chemia)

W wyniku interkalacji następuje deformacja w DNA podwójnej helisie DNA. Po lewej podwójna helisa DNA. Po prawej podwójna helisa po interkalacji (trzy miejsca interkalacji oznaczono kolorem czarnym).

Interkalacja – zjawisko wiązania niewielkich cząsteczek, wewnątrz cząsteczek związków wielkocząsteczkowych lub wewnątrz struktur ponadcząsteczkowych zbudowanych z cząsteczek związanych ze sobą np. wiązaniami wodorowymi, czy oddziaływaniami van der Waalsa.

Przykładem interkalacji jest tworzenie się stabilnych kompleksów z przeniesieniem ładunku pomiędzy DNA a planarnymi cząsteczkami, które dzięki swej płaskiej strukturze maja zdolność wsunięcia się pomiędzy sąsiadujące ze sobą pary zasad nukleinowych. Takie niewielkie cząsteczki przyłączające się do makrocząsteczek nazywane są interkalatorami.

Przykład:

  • Bromek etydyny interkaluje między sąsiadującymi nukleotydami wzdłuż DNA powodując lokalne rozkręcenie o 26 stopni, co wydłuża formy liniowe i rozkręca formy koliste DNA. Efektem jest zmniejszenie ruchliwości elektroforetycznej o około 15%.
  • Innym przykładem interkalatora jest oranż akrydyny i DAPI.

Media użyte na tej stronie

DNA intercalation.svg
transfered from english wikipedia An illustration of DNA intercalation. Left: unchanged DNA strand. Right: DNA strand intercalated at three locations (black segments). Image created by Karol Langner (2005) and released into the public domain.