Marta Szachniuk

Marta Szachniuk
Data i miejsce urodzenia9 lutego 1974
Poznań
Profesor nauk inżynieryjno-technicznych
Specjalność: bioinformatyka, algorytmika
Alma MaterPolitechnika Poznańska
Doktorat2005 – informatyka
Politechnika Poznańska
Habilitacja2015 – informatyka
Politechnika Poznańska
Profesura2020
Pracownik naukowy
UczelniaPolitechnika Poznańska
Okres zatrudn.1999 - nadal
InstytutInstytut Chemii Bioorganicznej PAN
Okres zatrudn.2003 - nadal

Marta Xymena Szachniuk (ur. 9 lutego 1974 w Poznaniu[1]) – polska inżynier informatyk i bioinformatyk, profesor nauk inżynieryjno-technicznych. Specjalizuje się w algorytmice, kombinatorycznych problemach biologii molekularnej, modelowaniu matematycznym oraz strukturach RNA[1]. Jest profesorem nadzwyczajnym i kierownikiem Zakładu Bioinformatyki Strukturalnej w poznańskim Instytucie Chemii Bioorganicznej PAN[2] oraz profesorem zwyczajnym w Instytucie Informatyki Wydziału Informatyki i Telekomunikacji Politechniki Poznańskiej[3][4]. Kieruje Laboratorium Bioinformatyki RNA w Europejskim Centrum Bioinformatyki i Genomiki[1].

Życiorys

W roku 1993 ukończyła I Liceum Ogólnokształcące im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu[1]. Studiowała na Politechnice Poznańskiej, gdzie w 1998 ukończyła studia magisterskie z informatyki na Wydziale Elektrycznym, a w 1999 - z matematyki na Wydziale Budowy Maszyn i Zarządzania. Stopień doktora nauk technicznych uzyskała na Wydziale Informatyki i Zarządzania PP w 2005 na podstawie rozprawy pt. Kombinatoryczna analiza widm 2D-NOESY w spektroskopii magnetycznego rezonansu jądrowego cząsteczek RNA, przygotowanej pod kierunkiem prof. Jacka Błażewicza. Habilitowała się w 2015 r. na podstawie pracy pt. Informatyczne aspekty opartej na NMR analizy struktur RNA. Tytuł profesora nauk inżynieryjno-technicznych został jej nadany w 2020[3]. Poza Politechniką od 2003 pracuje także w Instytucie Chemii Bioorganicznej PAN, gdzie w 2016 awansowała na stanowisko profesora nadzwyczajnego[1]. Od 2011 r. jest wiceprezesem Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego[1]. W okresie 2009-2015 była członkiem rady zarządzającej EURO CBBM (ang. EURO Working Group on Operations Research in Computational Biology, Bioinformatics and Medicine), zaś od 2016 r. jest wiceszefem EURO CBBM (ang. EURO Working Group on Operations Research in Computational Biology, Bioinformatics and Medicine)[1]. W latach 2005-2007 należała do IEEE Computational Intelligence Society oraz IEEE Women in Engineering[1].

Dorobek naukowy

Specjalizuje się w algorytmice, biologii molekularnej, modelowaniu matematycznym oraz strukturach RNA[1]. W ramach badań rozwija wraz ze współpracownikami metody obliczeniowe służące do modelowania oraz analizy drugo- i trzeciorzędowej struktury RNA. Rezultatem tych prac jest platforma RNApolis, obejmująca zestaw narzędzi bioinformatycznych związanych z badaniem struktury RNA[2][5], wśród nich cieszący się bardzo dużym zainteresowaniem na świecie serwer RNAComposer umożliwiający automatyczne modelowanie struktur RNA na podstawie sekwencji nukleotydów[6][7]. Jest autorką artykułów naukowych w wysoko notowanych czasopismach naukowych[8], m.in. w Bioinformatics, Nucleic Acids Research, RNA i BMC Bioinformatics[9][10][11].

Nagrody i wyróżnienia

W 2006 otrzymała prestiżową nagrodę EDDA (EURO Doctoral Disseration Award) za najlepszą w Europie rozprawę doktorską w dziedzinie badań operacyjnych przyznaną przez ang. The Association of European Operational Research Societies[1].

Za prace nad metodami rozpoznawania i modelowania struktur 3D RNA otrzymała w 2017 r. nagrodę naukową Wydziału IV Nauk Technicznych PAN[12].

Kierowane projekty badawcze

  • 2017–2020: kierownik grantu NCN OPUS 12 „RNApolis – metody i algorytmy do modelowania i analizy struktury RNA”[13]
  • 2020–2023: kierownik grantu NCN OPUS 18 „Eksploracja cech i modelowanie struktury kwadrupleksów”[14]

Przypisy

  1. ↑ a b c d e f g h i j Marta Szachniuk CV (ang.). cs.put.poznan.pl. [dostęp 2020-07-16].
  2. ↑ a b Zakład Bioinformatyki Strukturalnej, ICHB PAN [dostęp 2021-01-25] [zarchiwizowane z adresu 2021-01-21].
  3. ↑ a b Prof. dr hab. inż. Marta Xymena Szachniuk, [w:] baza „Ludzie nauki” portalu Nauka Polska (OPI) [online] [dostęp 2020-07-16].
  4. ↑ Pracownicy / dr hab. inż. Marta Xymena Szachniuk. Wydział Informatyki Politechniki Poznańskiej. [dostęp 2020-07-16]. [zarchiwizowane z tego adresu (2016-06-30)].
  5. ↑ RNApolis, Rnapolis.pl [dostęp 2020-07-16].
  6. ↑ Ludwika Tomala, RNA w 3D? Polacy zostawiają konkurencję w tyle!, [w:] Nauka w Polsce [online], PAP, 10 stycznia 2018 [dostęp 2020-07-16].
  7. ↑ RNAComposer, ICHB PAN [dostęp 2020-07-16] (ang.).
  8. ↑ Wykaz czasopism naukowych i recenzowanych materiałów z konferencji międzynarodowychwraz z przypisaną liczbą punktów, Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego, 20 grudnia 2019 [dostęp 2020-07-16].
  9. ↑ Marta Szachniuk (publikacje i cytowania) (ang.). scholar.google.pl. [dostęp 2020-07-16].
  10. ↑ Marta Szachniuk (ang.). publons.com. [dostęp 2020-07-16].
  11. ↑ Marta Xymena Szachniuk (ang.). researchgate.net. [dostęp 2020-07-16].
  12. ↑ Przyznano tegoroczne Nagrody Wydziałowe PAN, Polska Akademia Nauk, 15 grudnia 2017 [dostęp 2020-07-16].
  13. ↑ RNApolis - metody i algorytmy do modelowania i analizy struktury RNA, NCN [dostęp 2020-07-16].
  14. ↑ Wyniki konkursów OPUS 18, PRELUDIUM 18, SONATA 15, PRELUDIUM BIS 1 (zob. Konkurs OPUS, Panel ST6), NCN [dostęp 2020-07-16].

Linki zewnętrzne