Putrescyna

Putrescyna
Ogólne informacje
Wzór sumaryczny

C4H12N2

Inne wzory

NH2(CH2)4NH2

Masa molowa

88,15 g/mol

Wygląd

białe, silnie higroskopijne ciało stałe lub bezbarwna ciecz o silnym zapachu podobnym do piperydyny[1]

Identyfikacja
Numer CAS

110-60-1

PubChem

1045

DrugBank

DB01917

Podobne związki
Podobne związki

kadaweryna, spermidyna, spermina

Jeżeli nie podano inaczej, dane dotyczą
stanu standardowego (25 °C, 1000 hPa)

Putrescyna[a], 1,4-diaminobutan – organiczny związek chemiczny, amina biogenna z grupy ptomain.

Putrescyna i kadaweryna zostały po raz pierwszy opisane przez lekarza Ludwiga Briegera w Berlinie w 1885 roku. Występuje w bardzo małych ilościach w moczu i ślinie, w której najwyższe stężenie osiąga zaraz po przebudzeniu.

Bierze udział w biosyntezie poliamin[6][7] (spermidyny i sperminy)[8].

Powstawanie

Powstaje w wyniku rozpadu białek np. gnicia przy udziale bakterii beztlenowych. Odpowiada za nieprzyjemny zapach rozkładającej się materii organicznej (mięsa, tkanek, zwłok) oraz za nieświeży oddech.

Biosynteza

W organizmach żywych putrescyna powstaje z L-argininy na dwóch ścieżkach: poprzez ornitynę lub agmatynę[9].

Biosynteza przez ornitynę

Ścieżka ta jest powszechna w świecie żywym[6][10][7]. L-Ornityna powstaje z L-argininy w wyniku hydrolizy katalizowanej przez arginazę (EC 3.5.3.1[11]):

L-Arginina + H
2
O
L-ornityna + Mocznik

Ornityna ulega następnie dekarboksylacji katalizowanej przez dekarboksylazę ornityny (ODC, EC 4.1.1.17[12]) w obecności fosforanu pirydoksalu[6][10][7]:

L-ornitynaPutrescyna + CO
2

Biosynteza przez agmatynę

Drugą ścieżką syntezy putrescyny, dominującą u roślin wyższych i spotykaną też u niektórych bakterii, jest dekarboksylacja argininy do agmatyny, z udziałem dekarboksylazy argininy (ADC, EC 4.1.1.19[13])[6][14]:

L-ArgininaAgmatyna + CO
2

Następnie deiminaza agmatyny (EC 3.5.3.12[15]) przekształca agmatynę w N[6][14]:

Agmatyna + H
2
O
N-Karbamoiloputrescyna + NH
3

Ostatnim etapem jest hydroliza grupy karbamoilowej przez amidazę N-karbamoiloputrescyny (EC 3.5.1.53[16])[6][14]:

N-Karbamoiloputrescyna + H
2
O
Putrescyna + CO
2
+ NH
3

Agmatyna może też ulegać bezpośredniej hydrolizie do putrescyny i mocznika. Reakcję tę katalizuje agmantynaza (EC 3.5.3.11[17]), enzym powszechnie występujący u różnych organizmów[18]:

Agmatyna + H
2
O
Putrescyna + Mocznik

Produkcja i zastosowanie

Putrescyna produkowana na skalę przemysłową jest surowcem do produkcji leków, środków ochrony roślin i polimerów. Reaguje z kwasem adypinowym do poliamidu nylon-4,6, który jest wprowadzony do obrotu przez koncern DSM pod nazwą handlową Stanyl.

Toksyczność

Putrescyna jest toksyczna w dużych dawkach. Dawka śmiertelna (LD50) dla zwierząt wynosi 0,5–1,6 g/kg przy podaniu doustnym[4].

Zobacz też

  • skatol

Uwagi

  1. Z łac. puter, dop. putris – „zgniły”, „cuchnący”.

Przypisy

  1. a b c d e f g 1,4-Diaminobutane, [w:] PubChem [online], United States National Library of Medicine, CID: 1045 [dostęp 2022-07-19] (ang.).
  2. a b c David R. Lide (red.), CRC Handbook of Chemistry and Physics, wyd. 90, Boca Raton: CRC Press, 2009, s. 3-72, ISBN 978-1-4200-9084-0 (ang.).
  3. Farmakopea Polska X, Polskie Towarzystwo Farmaceutyczne, Warszawa: Urząd Rejestracji Produktów Leczniczych, Wyrobów Medycznych i Produktów Biobójczych, 2014, s. 4276, ISBN 978-83-63724-47-4.
  4. a b c Putrescyna (nr 32790) w katalogu produktów Sigma-Aldrich (Merck KGaA). [dostęp 2022-07-19].
  5. Putrescine, [w:] ChemIDplus [online], United States National Library of Medicine [dostęp 2022-07-19] (ang.).
  6. a b c d e f Colin Hanfrey i inni, Arabidopsis polyamine biosynthesis: absence of ornithine decarboxylase and the mechanism of arginine decarboxylase activity, „The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology”, 27 (6), 2001, s. 551–560, DOI10.1046/j.1365-313x.2001.01100.x, PMID11576438 [dostęp 2022-07-19] (ang.).
  7. a b c Andrew D. Kern i inni, Structure of mammalian ornithine decarboxylase at 1.6 A resolution: stereochemical implications of PLP-dependent amino acid decarboxylases, „Structure (London, England: 1993)”, 7 (5), 1999, s. 567–581, DOI10.1016/s0969-2126(99)80073-2, PMID10378276 [dostęp 2022-07-19] (ang.).
  8. Putrescine biosynthesis I, [w:] MetaCyc [online], SRI International [dostęp 2022-07-19].
  9. Superpathway of putrescine biosynthesis, [w:] MetaCyc [online], SRI International [dostęp 2022-07-19].
  10. a b Wolfgang Legrum, Riechstoffe, zwischen Gestank und Duft, wyd. 1. Aufl, Wiesbaden: Vieweg + Teubner Verlag, 2011, s. 65, ISBN 978-3-8348-1245-2, OCLC 754219016.
  11. EC 3.5.3.1, Międzynarodowa Unia Biochemii i Biologii Molekularnej [dostęp 2022-07-19] (ang.).
  12. EC 4.1.1.17, Międzynarodowa Unia Biochemii i Biologii Molekularnej [dostęp 2022-07-19] (ang.).
  13. EC 4.1.1.19, Międzynarodowa Unia Biochemii i Biologii Molekularnej [dostęp 2022-07-19] (ang.).
  14. a b c K.S. Srivenugopal, P.R. Adiga, Enzymic conversion of agmatine to putrescine in Lathyrus sativus seedlings. Purification and properties of a multifunctional enzyme (putrescine synthase), „Journal of Biological Chemistry”, 256 (18), 1981, s. 9532–9541, DOI10.1016/S0021-9258(19)68795-8, PMID6895223 [dostęp 2022-07-19] (ang.).
  15. EC 3.5.3.12, Międzynarodowa Unia Biochemii i Biologii Molekularnej [dostęp 2022-07-19] (ang.).
  16. EC 3.5.1.53, Międzynarodowa Unia Biochemii i Biologii Molekularnej [dostęp 2022-07-19] (ang.).
  17. EC 3.5.3.11, Międzynarodowa Unia Biochemii i Biologii Molekularnej [dostęp 2022-07-19] (ang.).
  18. Iva Chitrakar i inni, Structure of the E. coli agmatinase, SPEB, „PLOS One”, 16 (4), 2021, art. nr e0248991, DOI10.1371/journal.pone.0248991, PMID33857156, PMCIDPMC8049259 [dostęp 2022-07-19] (ang.).

Media użyte na tej stronie

Diaminobutane.svg
Szkieletowa formuła putrescyna.
Agmatine.svg
Chemical structure of Agmatine
L-Ornithine structure.svg
Structure of L-Ornithine (Orn).
GHS-pictogram-acid.svg
Globally Harmonized System of Classification and Labelling of Chemicals (GHS) pictogram for corrosive substances
GHS-pictogram-skull.svg
Globally Harmonized System of Classification and Labelling of Chemicals (GHS) pictogram for toxic substances
Harnstoff.svg
Structure of Urea